כתבים משלו
אגרת השמד
י' שבט תרצ"ז (1937), דפוס רוהלר ירושלים, 8 עמ'.
רפורטז'ה של בחור "ישיבה" (יומן בית הסוהר)
הוצאת חזון בע"מ, תל-אביב, 1946, 184 עמ'
ספריית תרמיל, משרד הביטחון ההוצאה לאור, 1984, 164 עמ'
בתרגום לרוסית: פנחס גיל, "פרוגרס מוציאים לאור", ירושלים, 1996, 214 עמ'
עם קריאת הגבר
הוצאת "עמיחי", תל-אביב, 1957, 336 עמ'
יודאיקה
הוצאת "אנקור", תל-אביב, 1960, 304 עמ'.
הציונות המהפכנית (כתבים נבחרים כרך א')
הוועד להוצאת כתבי אחימאיר, תל-אביב, 1966, 304 עמ'.
המשפט (כתבים נבחרים כרך ב')
מבוא: ד"ר יוסף נדבה
הוועד להוצאת כתבי אחימאיר, תל-אביב, 1968, 256 עמ'
הדפסה שניה בכריכה רכה, 1973
ברית הבריונים (כתבים נבחרים כרך ג')
מבוא: פרופ' יוסף נדבה
הוועד להוצאת כתבי אחימאיר, תל-אביב, 1972, 229 עמ'
מותו של יוסף כצנלסון * לאחר האהבה, לאחר השנאה (ברל כצנלסון) (כתבים נבחרים כרך ד')
מבוא: יוסף אחימאיר
הוועד להוצאת כתבי אחימאיר, תל-אביב, 1974, 241 עמ'
אטלאנטידה או עולם ששקע (כתבים נבחרים כרך ה')
המלבה"ד: זאבה אחימאיר-זבידוב ויוסי אחימאיר
הוועד להוצאת כתבי אחימאיר, תל-אביב, 1996, 324 עמ'.
עין הקורא, ספרים וסופרים, עיתונאים ועיתונים (כתבים נבחרים כרך ו')
פתח דבר: יוסי אחימאיר
הוועד להוצאת כתבי אחימאיר, תל-אביב, 2003, 344 עמ'.
בכרך מאמרים (בסדר אלף-ביתי) על:
עמנואל אולסבנגר, נ. ה. אימבר, אלישבע, י. ז. אנוכי, ש. אנ-סקי, שלום אש, ח. נ. ביאליק, איתמר בן-אב"י, אליעזר בן-יהודה, ר' בנימין, מרדכי בן-עמי, ש. בן-ציון, מכס ברוד, ראובן בריינין, א. מ. ברכיהו, שמעון ברנפלד, י. ח. ברנר, אשר ברש, יהודה גור, שמריהו גורליק, י. ל. גורדון, אבא גורדין, משה גרוסמן, אורי צבי גרינברג, אביגדור גרינשפן, שמעון דובנוב, אלתר דרויאנוב, ש. א. הורודצקי, חיים הזז, שמעון הלל'ס, אברהם ויסוצקי, צבי ויסלבסקי, אלכסנדר זאובר, יעקב חורגין, יוחנן טברסקי, שאול טשרניחובסקי, יעקב יערי-פולסקין, יעקב כהן, אברהם כהנא, בן-ציון כץ, ה. ליוויק, יצחק למדן, יהודה מרגולין, שמואל ניגר, נחום סוקולוב, נחום סלושץ, משה סמילנסקי, שלמה סקולסקי, משה סתוי, ש"י עגנון, יוחנן פוגרבינסקי, שמואל פרלמן, דניאל פרסקי, י. ל. פרץ, הלל צייטלין, אהרון קלאוס, יוסף קלוזנר, יעקב קלצקין, ארתור קסטלר, יצחק קצנלסון, אברהם קריב, עזריאל קרליבך, אהרון ראובני, יעקב רבינוביץ, מיכל רבינוביץ, י. ח. רבניצקי, אברהם רייזין, שלמה רייכנשטיין, ל. ריקליס, י. צ. רמון, ברוך שוחטמן, ג. שופמן, ש. ז. שוקן, א. י. שטיבל, יעקב שטיינברג, יצחק שלו, גרשם שלום, שלום-עליכם, דוד שמעוני, זלמן שניאור, יעקב שצקי, אברהם שרון.
איילה בין החומות, יומן המשפט והסוהר, 1935-1934,
עריכה והגהה: זאבה אחימאיר-זבידוב, בהשתתפותם של יעקב אחימאיר ויוסי אחימאיר,
הוצאת מכון ז'בוטינסקי בישראל, דפוס האוזר גבעתיים, 2023, 533 עמ'.